非核算的分公司纳税的方式：把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。除了企业所得税可以由总公司汇总申报缴纳之外，其余的税款在登记地税务机关申报缴纳。
【本文关联的相关法律依据】
《企业所得税法》第五十一条
非居民企业取得本法第三条第二款规定的所得，以机构、场所所在地为纳税地点。非居民企业在中国境内设立两个或者两个以上机构、场所，符合税务主管部门规定条件的，可以选择由其主要机构、场所汇总缴纳企业所得税。
非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得，以扣缴义务人所在地为纳税地点。